Planul de amenajare integrala a bazinului Missouri (inclusiv afluentii) prevedea realizarea a 103 baraje si tot atatea lacuri de acumulare, cu un volum total de 143 Miliarde m3, 27 hidrocentrale cu o putere instalata de 2511 MW, cu o productie de energie electrica de 10235GWh/an. Printre lacurile de acumulare cele mai mari, de pe Missouri propriu-zis, mentionam Garrison (Sakakawea) cu 30,6 km3 si 1560 km2, Oahe cu 29,1 km3 si 1500 km2 si Fort Peck cu 24,8 km3 si 1000 km2. Prin realizarea progamului s-a regularizat scurgerea, evitandu-se inundatiile si asigurandu-se un volum acceptabil de apa in perioadele secetoase din an.
Primii exploratori pe Missouri au fost Louis Jolliet si Jacques Marquette, care, in 1673, coborand pe Mississippi de la izvoare au ajuns la confluenta cu acesta, si pe care a urcat o anumita distanta. Cunoscut sub denumirea originala de Pekitanoui, raul a fost explorat in cursul inferior in secolul 18 de catre negustori.